O Linux não precisa de antivirus, mas se você possui uma partição com windows seria interessante instalar ara verificar arquivos do windows.
INSTALANDO
apt-get install clamav
ESCANEANDO:
clamscan -vir /diretorio/ou/arquivo/a/vasculhar
Eu utilizo ele assim, porem um clamscan --help vai lhe trazer dezenas de
opcoes.
ATUALIZANDO ANTIVIRUS:
E tambem nao esquecer com freshclam para atualizar a base de dados de virus.
REMOVENDO VIRUS ENCONTRADO
clamscam --remove arquivo
Tem uma materia legal sobre clamav no 'guia do hardware'
Mais dicas sobre clamav